①구분경리의 구분-일반회계외 특별회계의 구분경리외에 수익사업과 비영리사업의 구분경리를 하여야 한다.  ②수익사업은 다시 법인세감면대상사업과 과세대상사업으로 구분경리를 하여야 한다.(실무상 소득구분계산서의 작성으로)  ④각 회계간의 거래 또는 이전은 별도의 법인간의 거래 또는 이전으로 인식함  ⑤고유목적사업에 이자소득을 지원하는 경우의 영리사업의 처리:차)고유목적사업준비금, 대)현금  ⑤고유목적사업에 이자소득을 지원하는 경우의 비수익사업의 처리:차)현금, 대)고유목적사업준비금수입(손익) 1.구분경리의 의의와 효과 (1)구분경리의 의의 비영리법인이 회계사항을 기록관리하는 데에 있어서는 각 회계단위별로 구분하여 기록관리하는 것을 요청받고 있다. 예를 들면, 정부업무등을 수탁받아 처리하는 비영리법인의 경우 자기의 회계와 수탁사업의 회계를 구분하는 경우, 목적사업별로 구분하여 경리하는 경우, 일반회계와 특별회계로 구분하여 경리하는 경우등이 있는 바 이러한 구분경리들은 그 비영리법인의 감독기관이나 근거법규에 의하여 예산의 흐름별로 고유하게 구분하여 경리하는 것을 의미 할 것이고…, 그 밖에도 비영리법인이 고유의 목적사업을 수행하는 데에 필요한 또는 부수되는 사업으로서 수익사업을 영위하는 경우에는 조세법에 의하여 수익사업과 비영리사업의 구분에 의한 경리를 다시하여야 하며, 나아가 그 수익사업중 일부가 조세법에 의하여 조세의 감면 또는 면제대상인 사업이 있는 경우에는 그 수익사업을 다시 감면대상사업과 과세대상사업으로 구분하여 경리의 관리를 하여야 한다. (2)구분경리의 대상 ①비영리법인의 수익사업과 비영리사업 ②세액감면대상사업과 과세대상사업의 구분 ③신탁소득의 구분경리 ④일반회계와 특별회계 예 시)대학교부설병원의 경우를 예시하면, 1차로는 학교사업과 병원사업의 회계를 구분하고, 2차로는 학교회계중 수익사업회계와 비영리사업회계를 구분하며 병원회계중 수익사업회계와 비영리사업회계를 다시 구분하여야 하고 3차로 각각의 수익사업회계중 감면대상사업이 있는 경우에는 그 감면대상사업을 다시 구분하여 경리하여야 한다. 실무상 2차구분경리와 3차구분경리를 여실히 이행하는 기관이 매우 드물다고 볼 것이다. (3)구분경리의 효과 편의상 3단계로 구분한 위의 각 구분경리를 이행하지 아니하는 경우에 비영리법인에 미치는 영향이 무엇인지를 살펴보면, 1차의 구분경리를 이행하지아니한 경우에는 그 비영리법인의 의결기관이나 감독기관 또는 근거법규에 의하여 제재가 있을 것이다.그리하여 이 1단계의 구분경리는 원활히 이루어지고 있다고 볼 수있다. 2차의 구분경리는 법인세법에 의하여 정하여진 규정이다.이를 이행하지 아니한다고 하여 별도의 불이행에 대한 가산세의 규제등이 있지 아니하고 다만 수익사업에 대한 법인세의 납세의무를 이행하였는지에 대하여만 문제시하는 상황이므로 이 2차의 구분경리는 실무상 이루어지지 아니하고 있는 경우가 많고 다만 결산시에 재무제표의 작성시에 합계잔액시산표자료를 양 회계로 분리하여 처리하는 실정이다. 법인세신고시에도 수익사업관련 재무제표만 제출하여도 되는 것으로 되어 있어서 비영리사업의 자료는 제출하지 아니하거나 수익사업자료에 혼재하여있는 경우가 많다. 비영리사업의 자료에 대하여는 법인세법이 정하는 사항이 아니고, 상속세법의 규정에 의하여 공익법인등(반드시 법인세법상의 비영리법인과 일치하지 아니함)이 재산을 출연받은 경우에는 그 출연받은 재산의 사용에 대한 계획 및 진도에 관한 보고서 즉 출연자산명세의 보고를 당해 사업연도 종료일부터 3월이내에 납세지관할 세무서장에게 하도록 하고 있고(동법 제48조 제5항,동령 제41조),이를 이행하지 아니하는 경우에도 상속세나 증여세를 부과하는 것은 아니고 미제출분 또는 과세제출분에 대한 상속,증여세상당액의 1/100에 상당하는 금액을 가산세로 징수하도록 하고 있는 바, 이 경우의 보고서식도 동법 시행령 별지 제23호∼25서식(부표3)서식에 의하는 것이므로 별도의 비영리사업관련 재무제표를 반드시 제출하여야 하는 것이 아니다. 3차의 구분경리 즉 감면대상사업의 구분경리는 비영리법인뿐 아니라 오히려 영리법인이 더 많이 적용되는 구분경리규정인 바, 실상은 영리법인의 경우에도 경리를 구분하여 한다기 보다는 법인세법 시행령 별지 제48호 서식인 소득구분계산서의 작성에 의하여 감면대상사업의 소득금액이나 과세표준을 계산하는 것으로 그치는 것이 일반적이다. 비영리법인인 학교법인이 예를 들어 복수의 수익사업을 영위하고 있으며 그 중 중소제조업을 영위하고 있는 경우라면 그 중소제조업에 대한 특별세액감면을 조세특례제한법 제7조의 규정에 의하여 적용받기 위하여는 다른 수익사업과 구분하여 경리를 하는 것이 원칙이다.이 경우에도 실무상은 소득구분계산서의 작성으로 마치는 것이 일반적이다. 2.수익사업과 비영리사업의 구분경리 (1)구분경리의 정의와 목적 ①비영리내국법인이 수익사업을 영위하는 경우 자산,부채 및 손익을 수익사업에 속하는 것과 비영리사업에 속하는 것을 각각 별개의 회계로 구분하여 경리하는 것이며 이는 법인세과세 대상인 소득금액계산을 목적으로 한다. ②수익사업의 과세소득을 계산하는 목적외에 각기의 특별법에서 비영리법인의 수익사업을 구분경리하도록 정하고 있는 바(예:구사립학교법 제6조,사회복지사업법 제17조),이 구분경리와는 별개로 다시 수익사업과 비영리사업을 구분하여 작성하여야 한다. ③전산화된 회계체계에서는 계정과목코드의 구분에 의하여 구분경리의 목적을 달성할 수있을 것이다.