거주자가 양도일로부터 소급하여 5년 이내 배우자 또는 직계존비속으로부터 증여받은 토지 및 주택 또는 부동산을 취득할 수 있는 권리(조합원입주권, 분양권 등), 특정시설물이용권을 양도하는 경우에 이월과세를 적용한다. 이월과세란 수증자가 증여받은 주택 등을 양도하는 경우 그 양도차익을 계산할 때 취득가액을 당초 증여자의 취득가액으로 한다는 규정이다. 5년 이내 양도하는 경우 적용되는 규정이므로 5년이 지나 양도하면 이월과세는 적용되지 않아 증여받은 취득가액을 인정받을 수 있다.다음 사례로 이월과세의 취지와 효과를 알아보기로 한다. 사례는 남편이 아내에게 주택을 증여하고 증여받은 아내가 1년 후 증여받은 주택을 양도하는 상황이다. 증여하는 주택은 과거 남편이 2억에 취득한 주택이며, 현재 시세는 6억원으로 시세대로 아내에게 증여를 했다. 배우자 간 증여는 10년간 합산하여 6억원까지는 세금이 부과되지 않으므로 증여세를 내지 않는다. 증여받은 아내가 1년 후 6억에 양도한다면 양도차익(양도가액 6억 - 취득가액 6억)이 없으므로 양도세가 없다. 결과적으로 증여세도 안 내고 양도세도 안 내게 되어 배우자 간 증여를 활용하여 남편이 증여 없이 6억에 양도했을 때보다 세금이 덜 나오게 될 수 있다. 이런 것을 방지하기 위해 이월과세란 제도를 두고 있다. 5년 이내 배우자 등으로부터 증여받은 주택 등을 양도하는 경우 취득가액을 당초 증여한 배우자가 취득한 취득가액으로 하는 이월과세제도를 두고 있다. 사례에서는 취득가액이 증여받은 6억이 아닌 남편의 당초 취득액인 2억이 되므로 양도차익은 4억이 된다. 만일 5년이 지나 양도하였다면 취득가액은 증여받은 취득가액인 6억이 된다. 이월과세는 증여를 이용한 양도세 회피를 방지하기 위한 제도이다.

양도세에서 특수관계인 간의 거래에서 조세부담을 부당하게 감소시킨 경우 그 행위, 계산을 부인하고 그와 관계없이 세법을 적용한다. 시가는 「상속세 및 증여세법」상 평가규정을 적용한다. 이를 양도소득의 부당행위계산부인이라고 한다. 조세부담을 부당하게 감소시킨 차이를 현저한 차이라고 하는데, 그 의미를 파악하고 두 가지 사례로 이해해보기로 한다.

특수관계인에게 자산을 증여한 후 그 자산을 증여받은 자가 증여일부터 5년 이내 타인에게 양도하는 경우 당초의 증여세와 증여받은 후 양도했을 때 계산한 양도세의 합계가 이 행위가 없었을 때의 양도세보다 적은 경우 증여 후 양도행위부인하고 당초 증여자가 타인에게 직접 양도한 것으로 보아 양도세를 계산한다. 아래 그림으로 이해해 보면 갑과 을은 특수관계인이다. 갑이 을에게 증여하여 증여세를 납부하고 증여받은 을은 5년 이내 병에게 양도하여 양도세를 납부하였다. 이때 만약에 갑이 병에게 직접 양도했을 때를 가정한 양도세, 당초의 증여세와 을이 납부할 양도세의 합계액을 비교하여 갑이 낼 양도세가 더 많다면 당초 행위를 부인하고 갑이 병에게 직접 양도한 것으로 보아 양도세를 계산하여 납부하는 것이다. 이를 증여 후 양도행위부인이라고 한다. 만약 배우자 등의 이월과세와 중복적용된다면 이월과세를 적용한다. 적용대상자산에는 제한이 없고, 수증자와 연대납세의무를 진다.